Proteger o cifrar un directorio

Desearia proteger uno o más directorios de /home pero de manera que se pueda ejecutar facilmente el proceso
de protección y desprotección, pues son directorios con información de uso diario. Al comenzar la sesión los
situaria en su ubicación desprotegida, para lo que haria falta una contraseña y al finalizar los volveria a encriptar
en la ubicación protegida.

He visto Herramientas gráficas para hacer esto pero con muchos pasos. ¿Hay algo prefabricado a tal efecto o
seria necesario crear un procedimiento bash (de lo que se poco más que nada)?